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Ce stage se déroule à l’université de McGill de Montréal, au Canada dans le département de physiologie. L’intitulé de mon stage est : Modeling calcium dynamics in dendritic spines.
A l’aide d’un modèle précédemment développé par d’anciens étudiants, il faut recréer en utilisant des équations ce qui a été observé in vivo. Ces équations doivent tenir compte de chaque paramètre physiologique : le courant d’activation des différents canaux (AMPA, RYR, etc) mais également la diffusion simple et la concentration de calcium dans chaque compartiment de l’épine dendritique.
Le résultat attendu est une courbe avec 2 maximums locaux avec la concentration en calcium en ordonnée et la durée de simulation en abscisse.
Une fois que ce sera fait, l’étape suivante sera de modéliser et observer les interactions entre les synapses et les épines dendritiques.
Ce stage s’est déroulé à l’Université McGill de Montréal dans le département de physiologie et concerne la modélisation des flux de calcium mis en jeu dans les processus de myélinisation d’axones par les cellules précurseurs d’oligendrocytes. Ayant rôle pour de déterminer si les pics de calcium enregistrés dans ces cellules sont dus au hasard. Pour cela, un modèle mathématique est utilisé simulant les flux traversant une cellule et à l’aide du langage de programmation Python,les données enregistrées sont classées dans différents clusters pour à terme observer un éventuel motif récurrent et confirmer ou infirmer l’hypothèse émise précédemment.
Le stage se déroule au Human Brain Control of Locomotion laboratory de Montréal. L’un de ses projets est actuellement de mesurer le rôle du cortex pariétal postérieur dans l’un des symptômes de la maladie de Parkinson: la paralysie temporaire de la marche, ou « freezing of gait » en anglais. L’objectif du stage est d’optimiser les algorithmes traitant les mesures effectuées sur les patients participant à ce projet.
Le stage se déroule à l’université de Berkeley en Californie et a pour sujet l’étude de la bactérie Xylella fastidiosa qui provoque la maladie de Pierce chez la vigne. C’est un stage mêlant microbiologie, biologie végétale et bio informatique.Les mesures ont été faites dans un champ de vigne.