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Une formation sur le catalogue
Ce stage se déroule à l’Université d’Umeå en Suède dans le domaine de l’astrobiologie. Ce stage est porté sur l’étude des tardigrades. Les tardigrades sont des petits animaux de moins d’un millimètre qui peuvent survivre à des températures extrêmes et dans des lieux comme l’espace ou l’eau. Le travail consiste plus précisément à répertorier les derniers tardigrades qui ont été découvert sur les trois dernières années pour réaliser par la suite une carte du monde avec les nouvelles espèces et comparer dans quel pays les tardigrades sont le plus présent ainsi que de comparer les différents gènes étudiés.
Le stage s’effectue au département dentaire de l’Hôpital universitaire d’Umeå. Le stage consiste en la réalisation d’un arbre phylogénétique de 15 souches d’ARNs de Fusobacterium nucleatum et l’analyse transcriptomique de la régulation de gènes sélectionnés dans les cellules souches SCAP co-cultivées avec des espèces bactériennes.
Le sujet de stage porte sur l’identification des pollen et des sous-espèces d’abeilles domestiques. L’analyse des grains de pollen permet d’identifier les fleurs que les abeilles d’une même ruche visitent. Cette analyse est aujourd’hui assez difficile à réaliser pour des apiculteurs car il s’agit d’observation au microscope et de description ou même d’analyse ADN. Notre travail consiste à la création d’une base de données de pollen qui pourra mener à un futur logiciel facilitant l’identification ainsi qu’à la création d’une archive d’échantillons de pollen qui pourront être utilisés dans de futures études environnementales.
Le sujet de stage porte sur l’identification des pollen et des sous-espèces d’abeilles domestiques. L’analyse des grains de pollen permet d’identifier les fleurs que les abeilles d’une même ruche visitent. Cette analyse est aujourd’hui assez difficile à réaliser pour des apiculteurs car il s’agit d’observation au microscope et de description ou même d’analyse ADN. Notre travail consiste à la création d’une base de données de pollen qui pourra mener à un futur logiciel facilitant l’identification ainsi qu’à la création d’une archive d’échantillons de pollen qui pourront être utilisés dans de futures études environnementales.
Les scientifiques s’attendent à ce que le changement climatique ait un impact sur la présence d’aflatoxines dans les aliments en Europe.Les aflatoxines sont des mycotoxines produites par des champignons. Les aflatoxines sont connues pour être génotoxiques, cancérigènes et réduisent le rendement des cultures. L’exposition des consommateurs à ces toxines par le biais des aliments doit être maintenue aussi faible que possible.Les céréales, les légumes, les épices, les huiles végétales brutes, les fèves de cacao et les noix sont concernés par cette toxine. Des limites maximales d’aflatoxines en Europe ont été établies en raison de leur cancérogénicité à très faible concentration. Règlement (CE) n° 1881/2006 de La Commission européenne fixe le taux maximal d’aflatoxines à 4 μg/kg d’aflatoxines totalesdans les produits destinés à la consommation humaine. Les produits dépassant ces tarifs ne peuvent être mis sur le marché dans l’UE. En raison du changement climatique, la contamination par l’aflatoxine devrait augmenter prochainement, au point de devenir l’un des principaux problèmes de mycotoxines aussi dans les régions tempérées. De nombreux efforts sont aujourd’hui consacrés à la recherche de stratégies. l’objectif de ce stage est de déterminer la structure de l’enzyme DypB grâce à un logiciel : Coot. Cette enzyme joue un rôle efficace dans l’oxydation des aflatoxines qui détruisent les récoltes céréalières, elles sont produites par des champignons : Aspergillus flavus et Aspergillus parasiticus.Connaître la structure de l’enzyme DypB permettra de fournir des détails importants entre l’interaction DypB-aflatoxine, et par la suite sauver les récoltes.
Stage réalisé à l’institut de cristallographie de Bari, en Italie. Cet institut fait parti du CNR italien, le Conseil National de la Recherche.
Étant au sein du groupe ‘Drug Design’ et plus précisément dans l’équipe INSIDE-L@B. Cette équipe est composée du Dr. Giuseppe Felice MANGIATORDI, un chercheur en modélisation moléculaire et chimie computationnelle (étant également le maître de stage), et de deux doctorants : Giuseppe LAMANNA et Pietro DELRE.
L’objectif des recherches est de créer des nouveaux composés bioactifs, avec des propriétés pharmacologiques spécifiques et qui sont facilement synthétisables en laboratoire. Le but est de mettre au point des nouvelles molécules candidates pour des traitements médicaux.
En ce moment, la cible de leur étude est le récepteur aux cannabinoïdes de type 2 (CB2R), qui est connu pour être impliqué dans des pathologies telles que les maladies neurodégénératives et le cancer.
Nous avons à disposition une liste de 26 molécules agonistes de ce récepteur. Mon objectif de stage est donc de générer des analogues de ces molécules, puis d’étudier leur propriétés pharmacologiques pour en sélectionner les meilleures. Les molécules sélectionnées seront envoyées à des laboratoires de chimie qui vont les synthétiser et les tester pour voir si ce sont de bons candidats potentiels.
Pour mener à bien ce projet, nous utilisons des logiciels très performants. La plateforme web DeLA-Drug (mise au point par les membres de l’institut) permet de générer une vaste librairie d’analogues d’agonistes du récepteur CB2R. Cette plateforme est une Intelligence Artificielle qui permet de créer des nouvelles molécules en effectuant des substitutions aléatoires à partir d’une molécule initiale choisie. Puis, nous allons effectuer des simulations d’amarrage moléculaire (docking simulations) pour étudier l’affinité des composés créés avec le récepteur CB2R. Pour cela nous utiliserons le logiciel 3D Maestro (de la suite Schrödinger).
Ce stage s’est déroulé a Groningen aux Pays-Bas plus précisément a l’UMCG (University Medical Center Groningen). le sujet de stage aborde le domaine de l’oncologie et de la biologie tout an gardant une partie informatique pour le traitement des images et des datas obtenues.En se concentrant donc sur la mesure des radicaux libre par imageries par résonance magnetique (IRM) mais a l’échelle nanométrique, dans les cellules cancéreuses. L’objectif de ce stage est également de déterminer comment les nanodiamants (sensibles aux radicaux libres utilisé donc comme capteurs) affectent la migration cellulaire cancéreuse et d’établir un lien avec la concentration de ces radicaux libres.
Durant ce stage comporte donc plusieurs missions:
– s’occuper des différentes cultures cellulaires
– mener les expériences sur machines
– analyser les datas et images obtenues a l’aide de plusieurs logiciels informatiques
Le stage se déroule bien, En ayant beaucoup de travail mais l’équipe est très accueillante et sympathique.
Ce stage me permet d’améliorer considérablement mon anglais et de découvir une nouvelle culture (ce n’est pas un mythe les hollandais sont bien tous a vélo )
Stage réalisé dans le Département de l’Agriculture, de l’Ichtyologie et du Milieu Aquatique de l’Université de Thessaly à Volos en Grèce. Le travail est realisé avec le professeur Kostas Konstantinos et Eleni Nikouli et Nikos Xypteras. la recherche va porter sur la nutrition des poissons d’élevage d’aquaculture.En essayant d’ajouter du xylooligosacharride à leur alimentation. Cet ajout aura un rôle de prébiotique; Ensuite il sera question de surveiller l’effet de cet ajout sur leur microbiote intestinal.
Le but du stage est de rechercher les différents gènes potentiel qui pourront être à la base du développement des médicaments contre wuchereria bancrofti. Pour cela une étude est faite sur un nématode du même type, mais qui est praticable en laboratoire et non pathogène pour l’homme. Les résultats recensés avec ce ver sont censés pouvoir être obtenue aussi avec wuchereria bancrofti puisque ces nématodes sont génétiquement très proche.Des analyses génomiques (comparaison génomique et alignement des séquences) nécessaires doivent être faites pour montré que les résultats seront les même ou non chez les deux nématodes.
Le but de ce stage consiste à s’intéresser à l’evolution génétique, à travers la perte de la diversité génétique sur des drosophiles issus de Californie.
En étant plusieurs laboratoire à travailler sur cette étude, dans ce stage il sera question de se concentrer sur l’étude des séquences issues des génomes des drosophiles obtenues pour chaque dizaine de génération.
1.Umea,Suède
1.Umea,Suède
1.Umea,Suède
1.Umea,Suède
3 & 4 Uméa, Suède
3 & 4 Uméa, Suède
3 & 4 Uméa, Suède
2.Bari, ITALIE
2.Bari, ITALIE
2.Bari, ITALIE
2.Bari, ITALIE
2.Bari, ITALIE
1.Bari, ITALIE
1.Bari, ITALIE
Groningen,Pays-Bas
Groningen,Pays-Bas
Groningen,Pays-Bas
Groningen,Pays-Bas
Groningen,Pays-Bas
Wien, Österreich
Wien, Österreich
Wien, Österreich
Wien, Österreich